Iniciação Científica (PIC) e Iniciação em Desenvolvimento Tecnológico e Inovação (PIBITI), II Encontro Anual de Iniciação Científica da Unespar

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IMPLEMENTAÇÃO EM MAPLE PARA O CÁLCULO ESTRUTURAL DE PROTEÍNAS
Demetrio Aquino Torgan

Última alteração: 2016-08-11

Resumo


Este trabalho é uma aplicação computacional de Álgebra Linear em uma classe de problemas de Geometria de Distâncias, conhecida na literatura como Discretizable Molecular Distance Geometry Problem (DMDGP). Nesta classe são estudados problemas práticos que envolvem  distâncias, relacionados à conformação molecular de uma proteína, tais problemas consistem em se determinar a posição espacial de cada átomo da molécula a partir de um conjunto esparso de distâncias entre eles, obtidas via experimentos de Ressonância Magnética Nuclear (RMN). ODMDGP é modelado por um grafo simples conectado, cujos vértices representam os átomos e, suas arestas, as distâncias intra-atômica conhecidas a priori. Por meio de um gerador artificial de moléculas simulamos algumas instâncias para um DMDGP, das quais extraímos suas matrizes de coordenadas cartesianas em . A partir dessas informações desenvolvemos um algoritmo capaz de encontrar uma estrutura tridimensional da proteína correspondente ao DMDGP simulado. O algoritmo foi implementado em linguagem Maple e todos os resultados podem ser visualizados usando o software GeoGebra.

Palavras-chave


Palavras-chave: Álgebra Linear; Cálculo Estrutural de Proteína; Branch and Prune; Maple, GeoGebra.

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