Oligoquetos aquáticas são animais bentônicos que vivem associados ao substrato de águas dulcícolas, como rios, lagos e brejos. Geralmente, esses indivíduos não são identificados além do nível taxonômico de classe ou sequer são contabilizados nas amostragens por conta da dificuldade de identificação.  O presente estudo teve como objetivo a identificação dos gêneros de Oligochaeta (Annelida: Clitelata) em sedimentos de rio. Para o presente estudo foi analisados o material da coleta realizada em agosto/2015, referente a cinco pontos amostrais ao longo do trecho longitudinal na bacia do Médio Iguaçu, sendo os rios Iguaçu e Vermelho em União da Vitória (PR) e Pintado em Porto União (SC). Nas 50 amostras de substrato analisados foi amostrado um total de 351 indivíduos de Oligochaeta, distribuídos entre a família Naididae e a subfamília Naidinae. A abundância total de organismo encontradas nos cinco pontos amostrais na Região do Médio Iguaçu relaciona-se à quantidade de matéria orgânica e ao tipo de substrato encontrado nos diferentes pontos amostrais. A região do Médio Iguaçu demonstrou-se um local favorável para colonização e o desenvolvimento destes organismos, tornando-se um local importante para a realização de estudos de diversidade de invertebrados deste grupo taxonômico.